Illumina定制芯片有两种：中高通量的iSelect定制芯片平台和中低通量的GoldenGate定制芯片平台。

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利用白血病基因表达PCR芯片研究者即能够利用该芯片简单可靠地同时检测白血病的发生和发展相关的基因表达。

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大鼠甲基化芯片2.1M经济型,大鼠全基因组甲基化芯片Rat DNA Methylation 2.1M Economy Whole-Genome Tiling - 4 Array SetForm

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棉花全基因组表达谱芯片所用的序列信息来自于RefSeq, UniGene, TIGR Plant TA 和TIGR Gene Indices等知名数据库，代表了43,803个棉花基因和转录本。

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蜜蜂基因组芯片 8×15K，支持自选基因

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马SNP芯片服务illumina EquineSNP50 Genotyping BeadChip

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连锁分析芯片是进行疾病连锁分析的最佳工具，目前有人类及小鼠共4款芯片可选择。

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